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lammps相关

LAMMPS软件replicate命令翻译

replicate 语法 replicate nx ny nz nx、ny、nz是各个方向上的重复因子。 描述: 在各方向上,重复当前的构型一次或多次。例如重复因子为2 2 2时,将通过复制各个方向的区域创建一个8倍数量的原子。当重复因子为1时,模拟的区域不变。当建立了新盒子后,它也会被划分为很多盒子,然后分配给个processor(根据processors……继续阅读 »

舍乎 2年前 (2020-11-01) 24665浏览 6618评论 0个赞

lammps相关

LAMMPS软件echo命令翻译

echo 语法 echo style style可以为none、screen、log、both 描述: 这个命令决定了LAMMPS是否输出输入文件里的命令到屏幕或者log文件中。如果输入文件中存在错误,那么这个命令有助于查看最后一条执行的命令。 command-line switch –echo可以用来代替这个命令。 默认: echo log ……继续阅读 »

舍乎 2年前 (2020-10-31) 21851浏览 6891评论 0个赞

lammps相关

关于msi2lmp出错unable to find…..data的解析——Pcff力场分配参数流程

看到很多研究人员在使用msi2lmp程序将Materials Studio模型结构转换到lammps data文件时出现很多错误,且不知道原因。所以我打算根据自己以前自学的知识和使用经验,对msi2lmp程序转化pcff力场模型的相关内容写几个笔记(个人能力有限,欢迎后期指正补充)。 想要转换并使用pcff力场,那么必须先了解一下pcff力场的知识。这第一篇……继续阅读 »

舍乎 2年前 (2020-10-31) 59588浏览 10065评论 5个赞

lammps相关

LAMMPS软件timestep命令翻译

timestep 语法: timestep dt dt是时间步长的大小(时间单位) 描述: 对下面的分子动力学模拟设置时间步长的大小。见units命令对时间单位的讨论。默认的时间步长与单位制的选择有关。 当run style为respa时,dt是外循环的时间步长。 默认: temestep=0.005tau 当units =lj时 timestep=1.0f……继续阅读 »

舍乎 2年前 (2020-10-30) 37548浏览 8434评论 0个赞