Linux系统批量修改文件名rename
例如，当前文件夹下有很多aaa.txt, bbb.txt, ccc.txt……….等多个文件，如果想要将这些文件改名为为aaa.out, bbb.out, ccc.out…… 输入命令：rename “.txt” “.out” ./*.txt 第一个引……
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LAMMPS软件undump命令翻译
undump 语法 undump dump-ID dump-ID为前面定义的dump命令的ID。 描述： 关闭前面定义的dump命令，使其不再执行。这个命令关闭了与dump命令相关的文件。 ……
LAMMPS软件uncompute命令翻译
uncompute 语法 uncompute compute-ID compute-ID是前面定义的compute的ID 描述： 删除一个前面利用compute命令定义的compute。这同时也会清除通过compute_modify命令对compute设置的任何改变。 ……
LAMMPS软件fix_modify命令翻译
fix_modify 语法： fix_modify fix-ID keyword value fix-ID是需要改变的fix的ID 可以加上一个或多个keyword/value对 keyword为temp、press、energy temp的值是计算温度的compute ID press的值是计算压力的compute ID energy的值为yes 或no ……
LAMMPS软件unfix命令翻译
unfix 语法 unfix fix-ID fix-ID是之前定义的fix命令的ID 描述： 删除之前fix命令定义的fix。这个命令同时会删除通过fix_modify命令施加给fix的其他改变。 ……
LAMMPS软件dump命令翻译
dump命令 语法： dump ID group-ID style N files args iD用户给dump命令定义的名字 group-ID要输出的原子组的名字 style包括atom、atom/mpiio、cfg、cfg/mpiio、dcd、xtc、xyz、xyz/mpiio、movie、molfile、local、custom、custom/mpii……
LAMMPS软件replicate命令翻译
replicate 语法 replicate nx ny nz nx、ny、nz是各个方向上的重复因子。 描述： 在各方向上，重复当前的构型一次或多次。例如重复因子为2 2 2时，将通过复制各个方向的区域创建一个8倍数量的原子。当重复因子为1时，模拟的区域不变。当建立了新盒子后，它也会被划分为很多盒子，然后分配给个processor（根据processors……
LAMMPS软件echo命令翻译
echo 语法 echo style style可以为none、screen、log、both 描述： 这个命令决定了LAMMPS是否输出输入文件里的命令到屏幕或者log文件中。如果输入文件中存在错误，那么这个命令有助于查看最后一条执行的命令。 command-line switch –echo可以用来代替这个命令。 默认： echo log ……
关于msi2lmp出错unable to find…..data的解析——Pcff力场分配参数流程
看到很多研究人员在使用msi2lmp程序将Materials Studio模型结构转换到lammps data文件时出现很多错误，且不知道原因。所以我打算根据自己以前自学的知识和使用经验，对msi2lmp程序转化pcff力场模型的相关内容写几个笔记（个人能力有限，欢迎后期指正补充）。 想要转换并使用pcff力场，那么必须先了解一下pcff力场的知识。这第一篇……
LAMMPS软件timestep命令翻译
timestep 语法： timestep dt dt是时间步长的大小（时间单位） 描述： 对下面的分子动力学模拟设置时间步长的大小。见units命令对时间单位的讨论。默认的时间步长与单位制的选择有关。 当run style为respa时，dt是外循环的时间步长。 默认： temestep=0.005tau 当units =lj时 timestep=1.0f……
LAMMPS软件run命令翻译
run： 语法： run N keyword values N步数 可以添加一个或多个关键字。 keyword为upto、start、stop、pre、every upto没有值 start的值为N1 N1为第一步开始的时间步。 stop的值为N2 N2为运算结束的时间步。 pre的值为yes或no post的值为yes 或no every的值为M、c1、c……
LAMMPS软件fix命令翻译
fix命令 语法： fix ID group-ID style args ID为用户给fix命令的名字 group-ID为施加fix命令的原子组的名字 style一种类型的名字 args某些特定类型的对象 描述： 向atoms施加特定的fix命令。在LAMMPS中，fix命令是在每步的计算中或者优化过程中需要施加给体系的任何所有的操作。例如根据时间积分更新原……
LAMMPS软件include命令翻译
include 语法： include file file是要转到的新的输入文件的名字。 描述： 这个命令打开一个新的输入文件，并开始从这个文件中读取LAMMPS命令。当这个新文件读取完时，再回到原来的文件。所要include的文件可以是任意长度。如果A中include了B，B中include了A，那么LAMMPS可能会运行相当长的时间。 如果文件名是个变量……
lammps软件compute msd命令翻译
compute msd命令 语法 compute ID group-ID msd keyword values… ID、group-ID详见compute命令 msd计算的类型。 可以添加0个或多个keyword keyword是com com值为yes或no 描述： 计算一组原子的mean-squared displacement（MSD），包括了原子通过……
msi2lmp使用方法-msi2lmp程序的README文件翻译
运行msi2lmp程序可能会出现很多错误，例如unable to find ….data（查看相关笔记）、出现多余原子的错误（查看相关笔记）等等 仔细阅读README文件是了解这个程序及分析产生错误原因的基础。因此所这个笔记对LAMMPS软件内所包含的msi2lmp工具中所带的README文件的翻译。 这个翻译可以解决使用过程中出现的某些错误。下……
centos下安装ovito，并利用putty+Xming远程查看（碰运气方法）
利用LAMMPS软件模拟获得的数据实在是太多了，一共1.7T都存在服务器上。个人电脑硬盘一共才1T。之前分析数据都是把服务器中的数据拷贝到个人电脑上分析，个人电脑是windows系统，用起来比较习惯。但是这次不行了，数据总量已经超过了我的个人电脑硬盘总量。被逼无奈只能尝试直接在服务器上查看分析数据。首先第一步就涉及到图形化显示模型。 之前一直用Windows……
lammps软件compute命令翻译
Compute命令 语法： Compute ID group-ID style args ID用户分配给compute命令的名字 group-ID要进行计算的原子组的名字 style可能的类型之一（见下文） args某些特定类型的对象 描述： 定义一种计算来计算一组原子的性质。利用compute命令计算的性质是瞬时值，也就是说他们是由当前步的原子信息计算得到……
学不好英语的原因？元音？
英语老师很生气的问：你们知道你们为什么学不好英语吗？你们知道原因吗？ 学生回答：AEIOU~~~~ 英语老师：~~~~~原因、原因，不是元音！！！ ……
lammps软件thermo命令翻译
thermo命令 语法：thermo N N: 每N步输出热动力学信息。 N可以是变量 描述： 在N的整数倍步和开始结尾步，计算打印热动力学信息（例如温度、能量、压力）。如果N为0时，仅打印开始和结尾的热动力学信息。 输出的内容和形式由thermo_style和thermo_modify命令控制。 N除了可以为数值外，还可以是equal_style的变量，通……
lammps软件neighbor命令翻译
neighbor命令 语法 neighbor skin style skin超过力的cutoff的多出的长度（距离单位） style为bin或nsq或multi 描述： 这个命令设置影响粒子对相邻列表的建立。在force cutoff加skin距离总和的范围内的所有原子对存储在这个列表中。通常情况下，skin距离越大，需要构建的neighbor list数量……
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| 2020-10-14 12:03:58 | 0 | accepted | comment_posted_2 | |
| 2020-10-17 07:54:14 | 0 | accepted | comment_posted_3 |
尝试一下
2020-10-17 15:54:14 发表在 建站是购买阿里云的虚拟主机还是速成美站？