利用LAMMPS软件模拟获得的数据实在是太多了,一共1.7T都存在服务器上。个人电脑硬盘一共才1T。之前分析数据都是把服务器中的数据拷贝到个人电脑上分析,个人电脑是windows系统,用起来比较习惯。但是这次不行了,数据总量已经超过了我的个人电脑硬盘总量。被逼无奈只能尝试直接在服务器上查看分析数据。首先第一步就涉及到图形化显示模型。
之前一直用Windows版的Ovito软件查看模型。Ovito软件简单易用,还能扩展自己想要的功能,一直觉得很好用。现在想继续利用Ovito软件查看模型,必须解决两个问题:1.centos系统安装Ovito软件;2.利用个人电脑远程连接centos图形化界面。
- ovito软件在Linux上的安装非常简单。其实Ovito并不需要安装,直接解压就可以。
tar -vxJf Ovito-XXXXXX.tar.xz
然后cd到bin文件夹下,直接运行./ovito就可以。
但是我安装最新版本3.3.1版本时出现问题:no Qt plugins。。。。。。。。
解决问题还需要查很多东西,费时间费精力,我就直接尝试其它版本的ovito。又下载了2.9.0版本的,还是出问题:/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.8’ not found
继续下载了3.0.1版本,神奇的事情发生了没有问题,直接能够运行了!!!
又继续尝试了3.2.1,仍然能够正常运行了!!
狗屎运简直逆天了!
- 在服务器centos系统安装ovito之后不能总是到服务器上查看,必须可以利用个人电脑远程连接服务器查看。我是利用了Putty+Xming方法远程连接的。这个方法直接百度就可以。我在这里简单写一下:
- 首先Xming官网下载软件,然后安装一直点 下一步
- 然后运行XLaunch,一直点下一步,最后完成。完成后默认已经运行xming
- 去Putty官网下载软件,然后安装。
- 打开putty后,输入服务器IP,端口默认22;转到data选项(左边)中输入用户名,其他默认;转到ssh-x11选项,选中 enable X11 forwarding,下面x display location中填写localhost:0;然后回到seesion中save后,open。
- 输入密码就可以连接远程服务器了,转到ovito的bin目录下运行./ovito,就可以打开ovito界面了。
到此为止就可以在个人电脑上远程连接centos服务器,并利用ovito查看模型文件了。
但是这种方法在查看时,图形加载比较慢。不知道直接用其它远程连接软件会不会更快一点,以后尝试了再写一个笔记。
PS:个人电脑系统为Windows 10,服务器系统为CentOS Linux release 7.3.1611